隐孢子虫和微孢子虫是近年来被报道较多的两种人兽共患寄生虫，引起的疾病以急性或慢性腹泻为主要症状。我国是养猪大国，也是猪肉消费大国，生猪跨区域运输及屠宰非常普遍，这为疾病的跨区域传播也带来一定的风险。本研究涉及的研究对象来自从辽宁省和吉林省的3个不同猪场中的216头猪，跨省市运输至浙江省宁波市进行集中屠宰。屠宰前采集粪便，进行隐孢子虫和微孢子虫的鉴定和基因型分析。结果发现有两例感染微小隐孢子虫（0.9%，2/216），毕氏肠微孢子虫的感染率可达25%（54/216）。在微孢子虫阳性样本中鉴定出7个新的基因型 （JLNB-1 -JLNB-7）和10个已知基因型(EbpA, CM11, H, CM6, pigEBITS1, EbpC, CS-4, pigEBITS5, CHS5, Henan-Ⅳ)，其中人兽共患基因型EbpA为主要基因型，基因型H和pigEBITS1为我国首次在猪体内发现的基因型。在这些猪群中发现微小隐孢子虫和人兽共患微小隐孢子虫基因型，揭示可能对接触的屠宰者及周围的环境带来潜在感染的风险，同时在跨地区运输的过程中，由于粪便的排泄也可能对途径地区环境等带来潜在的危险。该研究结果提示在动物跨区域运输中应做好相应的防护措施，避免病原体对目的地和途经环境及接触人群的感染。

本文第一作者是中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所刘华副研究员，于2021年3月发表在《Microbial Pathogenesis》。