In Silico Evaluation of the Haplotype Diversity, Phylogenetic V ariation and Population Structure of Human E. granulosus sensu stricto (G1 Genotype) Sequences
发布科室：重点实验室 发布作者：寄生虫病所
囊型棘球蚴病（CE）是一种严重的、被忽视的人畜共患病，被食品和农业组织和世界卫生组织列为全球第三大食源性寄生虫病。该病全球分布，造成巨大经济损失。引起CE的病原是细粒棘球绦虫广义种（E. granulosus s.l.）。通过分析线粒体细胞色素氧化酶c第I亚基（mt-CO1）和NADH脱氢酶第I亚基（mt-ND1）序列，可了解棘球绦虫群体遗传结构和亲缘关系密切程度，对揭示其种群动态具有重要意义。基于此，近年来已陆续报道了细粒棘球绦虫广义种的遗传多样性，包括细粒棘球绦虫狭义种（G1和G3）、马棘球绦虫（G4）、奥式棘球绦虫（G5）、加拿大棘球绦虫（G6、G7、G8、G9、G10）和狮棘球绦虫，其中，细粒棘球绦虫狭义种（G1）最为常见，占人囊型棘球蚴病病原体的89%，也是“人畜共患”特征最明显的虫株。本研究对全球不同地区提交到GenBank的273份人细粒棘球绦虫狭义种（G1）的mt-CO1（n=133）和mt-ND1（n=140）基因序列进行分析，评估其单倍体多样性、遗传变异、种群结构和系统发育。发现在mt-CO1基因序列中有31个位点发生突变，在mt-ND1基因序列中有100个位点发生突变，同时鉴定出34个mt-CO1单倍型和37个mt-ND1单倍型，结果表明西方国家细粒棘球绦虫人分离株的遗传变异高于东方国家，这可能是动物贸易和自然选择导致的人口扩张所致。本研究首次对来自全球的细粒棘球绦虫狭义种（G1）人分离株进行了遗传结构和基因流动方面的生物信息学分析，并筛选和汇总了相关序列信息，研究结果有利于该疾病在今后的流行病学、生物生态学、疫苗和诊断等方面的深入研究。
本文第一作者为土耳其锡尔特大学Muhammed Ahmed Selcuk，中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所（国家热带病研究中心）曹建平研究员为共同通讯作者。该文于2022年11月14日在线发表于《Pathogens》杂志。
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文章录入： 责任编辑： 发布时间：2022-12-01 12:36:02
