蜱可以携带和传播包括细菌、病毒和原生动物在内的大量病原体，对人类健康和畜牧业生产发展构成巨大威胁。以往的调查表明，上海地区硬蜱的优势种为褐黄血蜱和长角血蜱。然而，近十年来，没有开展任何相关的调查和研究。因此，我们调查了血蜱的细菌群落和病原体。从上海的18个地点采集了硬蜱，并用形态和分子方法进行了鉴定。从混合样本中扩增出细菌16S rRNA基因的V3-V4高变区，并进行宏基因组分析。利用包括观察到的observed species和Shannonn diversity index在内的α多样性指数来估计蜱样本中的微生物多样性。使用QIIME软件确定的Unifrac距离矩阵用于未加权的Unifrac主坐标分析(PCoA)。用属特异性或种特异性巢式聚合酶链式反应(PCR)筛选混合蜱DNA样本中的蜱传病原体，并结合测序分析确认细菌16S rRNA基因V3-V4高变区的结果。在本研究中，我们发现褐黄血蜱和长角血蜱是上海地区的优势蜱种。Proteobacteria，Firmicutes，Bacteroidetes 和 Actinobacteria是血蜱的主要细菌种群。Proteobacteria，Firmicutes ａｎｄ Bacteroidetes的总物种丰度分别为48.8%、20.8%和18.1%。在属分析水平上，长角血蜱和褐黄血蜱携带至少946个属的细菌。丰度较高的细菌属包括Lactobacillus，Coxiella，Rickettsia 和Muribaculaceae。此外Rickettsia rickettsii，Rickettsia japonica, Candidatus Rickettsia jingxinensis, Anaplasmabovis, Ehrlichiaewingii, Ehrlichiachaffeensis, Coxiella spp. 和Coxiella-ｌｉｋｅ endosymbiont在从上海地区采集的血蜱中检出。本研究首次报道了血蜱的细菌群落和一些主要病原菌的流行情况。这可能会为蜱的细菌群落和主要病原体的流行提供参考和证据。这项研究还表明，上海地区的人和动物存在感染多种蜱传病原体的风险。

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