芽囊原虫和毕氏肠微孢子虫是常见的肠道病原体，能够感染人类和多种动物，可引起严重腹泻和其他肠道疾病，对公共卫生构成威胁。巴马香猪作为广西壮族自治区巴马瑶族自治县的特产，是该地区猪肉市场的重要本地品种，也是生物医学研究的优秀模型动物。目前，尚无关于芽囊原虫和毕氏肠微孢子虫在巴马香猪中的流行率或基因型分布的数据。本研究旨在通过基于芽囊原虫的小亚基核糖体RNA（SSU rRNA）基因片段和毕氏肠微孢子虫的内转录间隔区（ITS）的分子技术确定巴马瑶族自治县三个巴马香猪养殖场中芽囊原虫和微孢子虫的流行率和遗传特征。对311份粪便样本中的所有阳性PCR产物进行测序，以鉴定这两种病原体的基因型。芽囊原虫和毕氏肠微孢子虫的总感染率分别为34.08%（106/311）和18.32%（57/311）。检测到芽囊原虫的三个亚型：ST1（n = 8）、ST3（n = 3）和ST5（n = 95）。其中，ST5是优势基因型，占89.62%（95/106），其次是ST1（7.54%，8/106）和ST3（2.83%，3/106）。检测到了毕氏肠微孢子虫的两种基因型：EbpC（n = 52）和CHG23（n = 5），其中EbpC是主要基因型。

  本研究中观察到了芽囊原虫（ST1、ST3和ST5）和毕氏肠微孢子虫（EbpC、CHG23）的人兽共患致病基因型，表明对公共卫生存在潜在威胁。研究结果为在该研究区域预防和控制这些人畜共患病原体提供了基础信息。有必要开展进一步的调查，以更好地了解这两种病原体在广西省内的遗传特征和潜在的动物传染性。

  该文发表于Animals, 2024,14: 3344。

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